水生生物主要受水文环境的影响，湖泊水深变化大、盐度变化大都是物种丰富的原因，而沿岸滩涂面积、流域气候对湖泊内水生生物多样性影响较小。

生物多样性通常有三个主要的内涵，即生物种类的多样性、基因（遗传）的多样性和生态系统的多样性．里海水域生活着多种多样的海洋生物，这体现了生物种类（物种）的多样性．