莲子草高10-45厘米圆锥根粗，直径可达3毫米 茎上升或匍匐，绿色或稍带紫色，有条纹及纵沟，沟内有柔毛，在节处有一行横生柔毛。
叶片形状及大小有变化，条状披针形、矩圆形、倒卵形、卵状矩圆形，长1-8厘米，宽2-20毫米，顶端急尖、圆形或圆钝，基部渐狭，全缘或有不显明锯齿，两面无毛或疏生柔毛叶柄长1-4毫米，无毛或有柔毛。
头状花序1-4个，腋生，无总花梗，初为球形，后渐成圆柱形，直径3-6毫米 花密生，花轴密生白色柔毛苞片及小苞片白色，顶端短渐尖，无毛苞片卵状披针形，长约1毫米，小苞片钻形，长1-1.5毫米花被片卵形，长2-3毫米，白色，顶端渐尖或急尖，无毛，具1脉雄蕊3，花丝长约0.7毫米，基部连合成杯状，花药矩圆形退化雄蕊三角状钻形，比雄蕊短，顶端渐尖，全缘花柱极短，柱头短裂
胞果倒心形，长2-2.5毫米，侧扁，翅状，深棕色，包在宿存花被片内。种子卵球形。花期5-7月，果期7-9月。
