这要看厂房的这个加高两米，屋面是通过正常手续和正常的加高程序，那没有，如果说是通过了这些程序的话是没有问题的。只要手续齐全就完全不违法的，当然手续不齐全的话，不等于你就一定违法，但只是违规了，也就是违规建房，违规加高房屋的高度，这样会责令拆除或者是进行处罚的。