鳄鱼身上的寄生虫很多。寄生虫有扁弯口吸虫、锚头鳋、中华鳋、孢子虫（胞囊）、球虫（艾美虫胞囊）、碘泡虫（胞囊）、绦虫、九江头槽绦虫、孢子虫、鱼怪等。