第136—139集，零知道柯南身份的。

柯南原本是组织的科学家宫野志保，因姐姐宫野明美被杀而吃药变小逃离组织被阿笠博士收留APTX4869药物秘密揭晓后零才得知柯南就是宫野志保

零什么时候知道柯南身份的

零也是在名侦探柯南国语版第986集的神秘黑暗组织人物事件中，才知道柯南的真实身份的，只不过柯南的另一个真实身份工藤新一还不知道。