研究的创新主要表现在以下两方面：

（1）本研究属于交叉研究，综合运用环境经济学、制度经济学、公共管理学的相关理论，从理论、实践和法理三个层面论证了政府介入环境保护、实施环境管理职能的必要性和依据。

（2）作为一种尝试与创新，本研究从宏观、系统的层面，针对我国现行环境行政监督管理体制存在的问题和面临的挑战，从机构设置、职能配置及运行机制等方面提出了具有操作性、建设性的对策建议，为我国环境行政监督管理体制的完善和制度创新提供理论依据与决策参考。