红头鼠鱼成鱼体长在5厘米左右，继承了红头鼠鱼体色淡雅的特点，鱼体眼睛部位有黑色的竖形纹路，从眼睛附近黑色斑纹到背鳍中间有块金色斑纹分布，鱼体背鳍前缘向后延伸到尾柄附近有宽阔的黑色线条斑纹，鱼体外形稍显修长。

成熟后黑金红头鼠雌鱼体型为橄榄状，鱼体腹部位置的线条向左右两侧扩张，从侧面观察鱼体可见到雌鱼随生殖巢，腹部较大。