第一步就是制得红曲霉菌。先准备好适合菌种生长的培养基，把菌种接种到培养基上。一段时间后再找出生长良好的菌落接种到新的培养基上。重复3次就能能到优质的红曲霉菌菌落。
第二步是配制孢子悬液。在装有菌落的容器中加入适量无菌水，让孢子混入无菌水中。再把溶液转入其他容器中，加入玻璃珠摇匀后就能到了孢子悬液。
第三步处理原材料。红曲米的原材料是大米，所以要选取优质的大米，除去杂质，提高纯度。然后加入适量冷水在室温下浸泡一天，使米粒充分吸收水分。浸泡后再把大米放到蒸锅中进行反复蒸煮。
把制得的孢子悬液和大米充分混合，然后进行发酵培养，时间为20天左右，期间要有足够的光照和适量的空气接触。
大米发酵完成后取出风干，在阳光下晒若干小时，但切忌暴晒。红曲米的制作就完成了
红曲米家庭自制做法
1/蒸米将优质大米淘洗干净，用清水浸泡60分钟左右，过滤，甩干。
2/将大米移入蒸笼中，用旺火烧至见有大量蒸汽时，即停止加火出笼。此时，米已蒸至半熟。
3/将半熟米倒入木桶中入少许凉水，并不停地上下翻搅，使其冷却，待温度降至20℃左右时，复入蒸笼用大火蒸，蒸至冒浓汽后，再蒸。15～20分钟，然后停火让其自然冷却，见无蒸汽冒时方可开笼出锅。
4/发酵将熟料倒入洁净木桶内，稍翻搅。当温度降至55～58℃时，将磨成粉状的“六二酒曲”撒入熟料中，搅拌均匀（配比量0.4%～0.6%）置于洁净的篾竹上，上覆清洁白布，周围用棉絮紧裹，保温55℃左右进行发酵。
5/24小进后（冬季需40小时），当物料升温至60℃时，将发酵料置于洁净水泥或瓷板上，用铁铲翻动，使之降温。当用手触摸索不烫手时，再将物料堆积并拍紧，盖上清洁白布，上再用麻袋盖好。24小时后，再将物料摊开，此时物料已呈淡红。
6/散温后，再次堆积。加盖麻袋，继续发酵。18小时后将发酵料移入洁净箩筐，连筐放入盛有15℃清水的陶瓷容器中，水深至刚浸没物料。30分钟后，取出箩筐，将物料置于瓷板上，再堆积12小时，至物料呈现深红色时即表示发酵结束。
7/将发酵好的物料转置通风处摊开，自然晾干，再入烘房干燥成粒状，即为成品。
8、美味又好吃的家庭自制红曲米完成开吃了。
