灵活就业开户和企业开户的区别如下：

1、参加的险种不同：灵活就业参保的是城乡居民社保，企业参保的是城镇职工社保

2、缴费的基数不同：灵活就业按照上年度全省在职的职工平均工资的40%-100%作为缴费基数，企业按照参保人年度月平均工资作为缴费基数

3、缴费的主体不同：灵活就业是个人承担所有费用，企业与参保人共同承担参保费用

4、户籍的限制不同：灵活就业必须是本地户口才可以参保，企业缴纳的职工社保就没有户籍的限制。