无所谓先用哪个，无论先使用哪个都可以。

如果C盘作为系统盘，空间较大，是可以作为存储盘使用的，但不推荐。所以，如果是存储文件，优先将其存储于D盘。存储于D盘，虽然不会带来性能的提升，也不会更加的安全，但是一旦系统发生故障，重装的时候无需拷贝资料，可以直接重装。