总理海军事务衙门，清末政府管理全国海军的机构。清末政府管理全国海军的机构。通称海军衙门﹐或称海署。光绪十一年九月(1885年10月)清政府设立，管理全国海军，统一海军的指挥权。海军衙门设总理1人，会办、帮办各2人，但实权为会办、北洋大臣李鸿章掌握。他趁机大力扩充北洋海军。中日甲午战争中，北洋海军覆灭。光绪二十一年(1895)海军衙门裁撤。