产量的区别，转基因农产品在产量上是要高出一筹，并且特别显著。转基因黄豆的产量是非转基因黄豆的5倍之多。

大小的区别，转基因黄豆的颗粒与非转基因黄豆要大一些。

转基因黄豆含油酯量稍低，但含蛋白质量略微高一点，在食用的时候，转基因黄豆腥味比较浓一些，并带有轻微的涩味，而非转基因黄豆则不相同。