两者在性质上、形成时间以及证据地位上均有不同。

1、证人证言具有客观性和稳定性，具有直接、显著的证明功能，往往形成于法律关系形成之前，在司法实践中是鉴别其它证据是否真实、可靠的重要依据

2、调查笔录具有很强的主观性，容易受到被调查人感知能力、个人喜好以及与当事人的关系等影响，往往形成于法律关系形成之后，在司法实践中也仅能作为辅助证据予以适用。