主要有2种途径，一种是动物通过食物直接获取，另一种是碳水化合物等在微生物作用下通过糖酵解和磷酸戊糖途径发酵产生，后者是动物体内最主要的 短链脂肪酸来源。

在养殖生产中，由于短链脂肪酸不稳定，通常将其包膜制成微胶囊颗粒或将其制成水剂使用和保存。