水飞朱砂和朱砂实质上是一样的，要说不同点在于水飞朱砂是朱砂加工过的一种形式水飞朱砂便于用药以及在吸收上有了很大的改变。

水飞朱砂是将朱砂放入水中研细，去除杂质，朱砂细净便于服用。天然朱砂成块状或片状，研细后方可服用。只要是纯正的好朱砂功效应相同。