南京博物院和总统府步行距离大约2.9公里，建议乘坐34路/5路公交车出行。

从总统府步行420米到大行宫东站上车，乘坐34路/5路（5站）中山门站下车，步行280米即到南京博物院。

还可以乘坐观光巴士东郊1线（费用较高），从总统府步行110米到梅园新村站 上车 ，2站路到南京博物院·中山门站下车即可。