2003年，广西民族博物馆开始兴建，占地面积约8.66万平方米，其中展厅面积约8，000平方米，附属有约4万平方米的广西传统民居建筑露天展示园。
2003年，自治区政府将其确定为重点公共文化设施建设项目，工程于2006年6月正式启动建设。
2008年，广西壮族自治区成立五十周年开馆时展出大型的广西民族文化陈列、东盟10国风情文化展示“东盟文化展”、五个少数民族自治区的联合邀请展“中国少数民族自治区文物精品特展”和特色鲜明的小型个人收藏展，可满足年接待观众100万人次的需要。
2017年5月18日，在首都博物馆接受晋级第三批国家一级博物馆授牌。
2017年12月，入选教育部第一批全国中小学生研学实践教育基地、营地名单。
广西民族博物馆主体建筑外形取材于富有广西地域特色和民族特色的铜鼓，整个建筑如一只展翅的鲲鹏，遨游于青山绿水之间。建筑面积29370平方米，其中展厅面积约8000平方米。整个馆区设有公共服务区、露天展示区、文物保护研究中心、业务与行政管理区、后勤服务区等五个功能区，内部设有高科技电影厅、多功能会议厅、文物标本观摩室、专题图书馆、网上博物馆等。
