遗传学的三大定律分别是：分离定律、自由组合定律和基因连锁、交换定律.

分离定律是这些定律的基础.其本质是等位基因在形成配子时的分离.这个可以用来解释单一性状的不同或者是单一新性状的出现和消失. 自由组合定律的主旨是，在等位基因分离的基础上，非等位基因的重新组合.它的提出是建立在非等位基因互相不影响的基础上，但其本质则是染色体的重组.这个主要是用来解释新的组合型性状的出现. 由上可以知道自由组合定律的本质是染色体的重组，所以不同的两个基因就可能存在与同一条染色体上，从而形成连锁.