it is clear that是主语从句。这个句子从形式上看it是主语，is clear是谓语，实际上，it只是代替that引导的从句作主语，真正的主语是that引导的从句（主语从句），本来的句子顺序是that… is clear.

如果这样就显得头重脚轻，句子也不太明朗。但是用itl代替从句作形式主语，把真主语放后面就很明朗了。