没有太大的区别。

1、工资基数的平均数以及上限，深圳要稍微高一点。

2、公积金如果转回深圳，只转余额，不转年限。

3、东莞交社保的期间，无法享受深圳的医保。

一、跨市转移养老保险：

1、参保人须持有效身份证原件到参保地的社会保障局打印《基本养老保缴费凭证》一份。

2、参保人返回户籍所在地就业参保或者在新就业地建立基本养老保险关系和缴费后，由用人单位或参保人携《基本养老参保缴费凭证》向新参保地社保经办机构提出基本养老保险关系转移接续申请。