1、参保人群不同
职工医保：主要面向有工作单位的在职职工或从事个体经济的灵活就业人员。居民医保：居民医保保障的人群是城镇居民医保和新农合覆盖的人群，上至老人，下至幼儿，只要未参加职工医保的，都可以自愿参保。
2、参保地不同
职工医保：随着参保单位变更而变更，若属于从事个体经济人员只能在户籍地参保。居民医保：只能在户籍地参保。
3、缴费方式及享受待遇不同
职工医保：由用人单位和职工个人共同缴纳，按月缴费缴费后，次月即可享受医保待遇。居民医保：个人承担所有保费，每年缴费一次。每年下半年到当地社区或村委会办理下一年度的参保手续，就可以享受次年全年的医保待遇，如果没有缴费，则次年不能享受。
4、缴费年限要求不同
职工医保：设立最低缴费年限，达到缴费年限的（一般男性25年、女性20年），退休后不再缴费即可享受基本医疗保险待遇。居民医保：不设立最低缴费年限，必须每年缴费，不缴费则不能享受医保待遇。
5、待遇标准不同
居民医保由于筹资水平较低，医疗待遇标准总体上略低于职工医保。
