农村信用社系统已关闭的意思指的是信贷系统关闭，不能办理信贷业务。其他常规业务系统是不会关闭的，因为信用社是存取款的服务行业，如果正常的存取u款系统关闭了不能正常营业会影响业务的发展。所以农村信用社系统关闭指的是信贷系统关闭。