注册资金50万与100万的不同点在于：

一、注册资金50万与100万对外承担责任的金额上限不同。注册资金50万以50万为上限对外承担责任，而注册资金100万则以100为上限承担责任。

二、注册规模大小不同。注册资金50万的注册规模要小于注册资金100万的注册规模。

三、对外从事合作业务的对象不同。注册资金50万的合作对象要少于注册资金100万的。