运输公司购买的车辆需要根据所购车辆的用途确定如何入账。如果运输公司购买的车辆是用于跑运输，入账时会计分录是：借：固定资产（如果是一般纳税人还要借：应交税费—应交增值税—进项税额），贷：银行存款。计提折旧时：借：主营业务成本，贷：累计折旧。如果购入的车辆是用于后勤管理部门，入账时会计分录是：借：固定资产（如果是一般纳税人，还要借：应交税费—应交增值税—进项税额），贷：银行存款。计提折旧时：借：管理费用，贷：累计折旧。