如果其孩子是在出院后去办理的报销，那就不能直接在医院进行结算。按照相关规定，当年出生的、具有农村户口的新生儿，家长参加了新农合的，新生儿生病住院后产生的符合报销情况的费用，可以直接挂在母亲的名下来向医保部门申请报销。

如果医院和区县医保部门联网，且新生儿在报销治疗费用前尚在医院救治，就可直接在医院结算。

如果新生儿此时已经出院，家长可携带相关证明和医院的治疗费用清单等，回到其家长参加新农合的当地医保部门申请报销。