用户办理了商转公以后，第一个月扣款是从用户关联的还款银行卡中扣除。

比如是建行的商业贷款转为建行公积金贷款，那么还款银行卡还是建行卡，系统仍然会从关联的建行卡中扣除每月还款金额。因此，只要办理好了商转公，还款银行卡的事情在办理业务时就一并处理好了。因此，用户每月都需要按照公积金贷款合同的约定，将还款资金存入还款银行卡中。