动画和漫画的侧重点有所不同。动画追求的是表现出军方及其背后的SEELE与NERV的微妙关系。而且叙事主体是碇真嗣，观众必须跟他同时目睹初号机，才会带来最大的震撼，这是影视类作品编剧的法则。