不算，癸是阴水，卯是阴木，水木相生，关系很好，天干地支纪年法中排第37位。通根指的是地支中藏有与日柱天干五行相同的五行。癸水通根的地支有子（藏癸水），丑（藏癸水），辰（藏癸水），申（藏壬水），亥（藏壬水），除此五个地支其他的地支中都没有藏水，不算通根。