安徽医保卡在重庆使用的话，要视具体情况而定的。

首先现在全国各地，都已经对医保卡系统进行了升级处理，这样医保卡持有人，只要在当地医保局进行核查就可以在全国各地使用了。比如安徽的医保卡持有人，只要在当地的相关部门进行了升级，一样可以在重庆使用的。当然，如果由于自己种种原因没有升级处理，可能在使用过程中会有一定的影响。