辣椒根系发育不良：冬季辣椒开花前受不良条件的限制，根系瘦弱不发达，花芽分化所需的营养供应不足春季结果后，肥水猛攻，造成伤根，根系供水供肥不足而落花落果。

辣椒管理不当：比如苗床管理不当形成大量弱苗、没有起高垄栽培、通风不当、浇水时大水漫灌、施肥不合理等，这些都能影响到作物根系的发育。