芒果核呈肾形或长卵圆形，略扁，像肾和卵。

芒果核长4～7cm，宽3～4.5cm，厚1～2cm，表面黄白色或土黄色，有数条略弯的浅沟纹，并被毛状纤维。果核坚硬，内含种子1枚，摇之发响。种子表面皱缩，种皮棕绿色至暗棕色，难与种仁剥离。子叶2片，肥厚，表面棕色，断面淡棕色，并有点状或条状的深色斑。气微，种仁味涩、微苦。