紫苏籽形状为小球形或者卵形颗粒状，籽粒直径大小在1～3 毫米之间，其籽粒表面颜色以灰褐色或灰棕色比较常见，表面有凸起的暗紫色网状纹路和圆形凸起的小点。籽皮具有薄、硬、脆的特点，比较容易压碎。

籽中含油高达45%左右，油中α-亚麻酸含量非常高，大约占紫苏油总脂肪酸含量的63%，亚油酸占约16%，油酸为11%左右，是一种优质的保健油脂。