星际战甲NS版本和PC版本的存档是不互通的，不过玩家可以把PC国际服的存档同步到NS版本。玩家只能够同步一次存档，同步后二者的存档完全独立，也不能够再次同步。在同步存档时，如果玩家NS版本有存档，会直接被PC版本存档覆盖。