袁崇焕斩杀毛文龙的行为，产生了极为深远的影响。

首先，清除了大明东北之地的隐患，沉重的打击了那些有拥兵自立之心的势力，彰显了大明的威严。

其次，成功的遏制了东江将权日益膨胀的趋势，虽然说，后来也有内斗的发生，但是，都成不了什么气候，已经没人敢嚣张跋扈的和朝廷作对了。

另外，毛文龙死亡之后，朝廷得以再次得到了国内部队的全部指挥权，严肃军纪之后，军队的战队力在短时间内便得到了提高。