主要区别是表现的情绪不同。

哎呦,是感叹词,表示惊讶,羡慕,害怕等情绪,女子用有时候还有撒娇卖萌的意味。

哎哟,也是感叹词,它表现的情绪是惊异,痛苦,这个词是男女通用,感情色彩较淡