1、表达意思不同

甚嚣尘上：原形容军中准备作战的情况。后形容议论纷纷或消息盛传。现在多指某种错误或反动言论十分嚣张。

沸反盈天：形容喧哗吵闹，乱作一团。

2、用法不同

甚嚣尘上：作谓语、宾语、定语。

沸反盈天：作谓语、定语、补语用于书面语。