过氧乙酸消毒液在猪舍用微粒子喷雾器喷雾，使喷出气溶胶粒覆盖于室内各种表面而达到消毒。这种消毒方法适用于养殖场所的地面、墙面、器具及车辆消毒。用0.05～0.5%或以上浓度的溶液以喷雾器喷雾，每立方用药20～30毫升，覆盖被消毒物体的表面。

带鸡喷雾消毒用0.1～0.3%的浓度，每立方米空间用15毫升，关闭门窗进行。

喷雾次数可根据鸡的不同生长时期，育雏鸡每日1次，育成鸡每2日1次，产蛋鸡可5～7天1次。