宇智波佐助断臂的原因是:佐助和鸣人的最终大战中，两人用尽了手段，最终使用千鸟和螺旋丸对战，这也导致了两人的一只手臂断了，可以说这是一个非常凄凉的结局，佐助为了赎罪放弃了给自己制造柱间细胞的手臂，最终以断臂的形态出现。