一是生长习性不同，水芹菜一般是生长在南方的河沟，水田旁边的，这里的水质深，土层肥沃。而中华芹多是旱芹，在北方地区常见。

二是形态特征不同。水芹茎小，是淡绿色的，闻起来有淡淡的香味。中华芹茎细长，是空心的，纤维粗，两者放在一起有明显的不同。