特曲和头曲的区别是接酒时间不同，酒质不同，发酵、贮存时间不同。

1、接酒时间不同：特曲是指酒经过蒸馏之后，出的第一段酒为特曲，随后的酒就叫头曲、二曲。

2、酒质不同：从酒质上来说，品质最好的酒曲，可被称作“特曲”，而后依次是“头曲”“二曲”“三曲”。

3、发酵、贮存时间不同：特曲酒大部分需要贮存三年，头曲则需要贮存一年。